Il cuore dell’archivio è costituito dai fascicoli relativi agli archivi degli Enti pubblici e dei privati dichiarati di interesse culturale in Liguria, archivi sui quali l’Ufficio esercita le sue funzioni istituzionali. La documentazione testimonia l’ampiezza dell'azione della Soprintendenza, sia nel fornire supporto tecnico e collaborazione ai proprietari degli archivi, sia nell'affrontare situazioni eccezionali, sia per vigilare sulle corrette pratiche di gestione, riordinamento, selezione, accesso, consultazione e valorizzazione. Oltre ad essere uno strumento di lavoro quotidiano indispensabile per la tutela degli archivi in quanto beni culturali, questo archivio è esso stesso un patrimonio culturale che documenta la ricchezza e varietà del patrimonio archivistico ligure e come è cambiata l'attività di tutela.