L’Archivio è costituito da diversi nuclei: il fondo “Museo Cesare Lombroso” conserva fotografie, disegni di tatuaggi, ritratti e manoscritti; il fondo “Cesare Lombroso” è riferito alla carriera e agli studi di Cesare Lombroso e conserva la sua corrispondenza. Quest’ultima è accessibile grazie al Lombrosoproject.  Il fondo “Mario Carrara” è costituito dalla documentazione relativa alla carriera accademica del genero di Lombroso; il fondo “Gina Lombroso” è riferito alle carte della secondogenita di Lombroso.
L’Archivio del Museo è accessibile online. In caso di consultazione è necessaria la prenotazione tramite email all’indirizzo: museo.lombroso@unito.it